Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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