Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms