Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clcn5Q9WVD4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clcn5Q9WVD4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms