Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TapbpQ9R233 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TapbpQ9R233 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms