Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms