Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AmfrQ9R049 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms