Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp11cQ9QZW0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms