Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms