Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ripk3Q9QZL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ripk3Q9QZL0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms