Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt3Q9QZ47 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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