Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb11Q9QY30 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms