Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms