Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip4Q9QXN3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip4Q9QXN3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms