Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms