Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid2Q9QUS6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms