Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms