Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TefQ9JLC6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TefQ9JLC6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TefQ9JLC6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms