Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace2Q9JL18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace2Q9JL18 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace2Q9JL18 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms