Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms