Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msgn1Q9JK54 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms