Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms