Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms