Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ercc6l2Q9JIM3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6l2Q9JIM3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms