Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem27Q9ESG4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms