Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc4Q9ES56 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms