Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk3Q9ERH7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk3Q9ERH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms