Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf21Q9EPU5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf21Q9EPU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf21Q9EPU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms