Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tysnd1Q9DBA6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tysnd1Q9DBA6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms