Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms