Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34b2Q9D9N2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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