Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Rnf138rt1Q9D9M9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Rnf138rt1Q9D9M9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf138rt1Q9D9M9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf138rt1Q9D9M9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf138rt1Q9D9M9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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