Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp12Q9D9M2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp12Q9D9M2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1090.2 ms