Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SlirpQ9D8T7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms