Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg13Q9D8C3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms