Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F2

Lypd6b, Ly6/PLAUR domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd6bQ9D7F2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Lypd6bQ9D7F2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lypd6bQ9D7F2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lypd6bQ9D7F2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms