Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Borcs6Q9D6W8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs6Q9D6W8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms