Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab11fip1Q9D620 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rab11fip1Q9D620 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rab11fip1Q9D620 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rab11fip1Q9D620 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rab11fip1Q9D620 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rab11fip1Q9D620 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab11fip1Q9D620 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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