Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f1Q9D5Q6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms