Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam227bQ9D518 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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