Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al3Q9D4U4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al3Q9D4U4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms