Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933421I07RikQ9D420 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933421I07RikQ9D420 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933421I07RikQ9D420 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms