Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt20Q9D312 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms