Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l4Q9D2A5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms