Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap5-3Q9D226 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms