Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Elp3Q9CZX0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms