Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms