Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms