Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
3100002H09RikQ9CXW6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms