Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nip7Q9CXK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms