Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sgo1Q9CXH7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms